酸碱性预测
将每个酸性氨基酸赋值为－1，包括天冬氨酸（D）、谷氨酸（E）、以及C端-COOH。每个碱性氨基酸赋值为＋1，包括精氨酸（R）、赖氨酸（K）、组氨酸（H）以及N端-NH2。然后计算整个多肽的电荷数。
按上述方法计算：如果整段肽的赋值为正，说明所带电荷是正电荷，该肽是碱性的；如果整段肽的赋值为负，说明所带电荷是负电荷，该肽是酸性的；如果赋值为零，该肽是中性的。
溶解方法选择
溶解性是使用多肽时比较重要的问题。每个氨基酸都有其固有化学特性。如亮氨酸Leu、异亮氨酸Ile、颉氨酸Val是疏水性的，其他氨基酸如赖氨酸Lys、组氨酸His、精氨酸Arg是碱性亲水的，再如谷氨酸Glu、天冬氨酸Asp是酸性亲水的。因此不同的多肽因其组成不同而具有不同的溶解性。
一般情况下，多肽首先选择溶解在灭菌的蒸馏水或去离子水中。
如果这个肽是不溶于水的，且其是酸性的，加入温和的碱如0.1%的NH3.H2O能够增加肽的溶解度。相反，对于碱性的肽，温和的酸如0.1%的醋酸或TFA(三氟乙酸)能够帮助多肽溶解。
某些肽具有很高的疏水性时，不易溶解，可以用少量的DMF或DMSO帮助其溶解，这时推荐将多肽溶解于少量纯有机溶剂，然后用水或缓冲液将其稀释到正常的工作浓度。因为盐会导致疏水性多肽的聚合，所以必须在多肽完全溶解后加入缓冲液进一步稀释。当您遇到这种情况时，请您注意以下几点说明：
a. DMF或DMSO的使用有助于多肽的溶解，这是通过破坏多肽的二级结构而助溶。
b. 这种试剂的使用可能会对其生物活性及后续的研究工作造成干扰，请您在溶解时考虑此问题。
如果溶解还是有问题，声波降解有助于溶解多肽。如果需要用到有机试剂溶解，建议在多肽加入有机试剂后即开始用超声波助溶，溶解后再加入水或缓冲液稀释，稀释过程中再次使用超声波助溶。
如果您在使用多肽产品时溶解性问题或其它问题，欢迎咨询，我们会提供最好的服务。